基于动态时间规划的基因芯片数据识别

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基于动态时间规划的基因芯片数据识别

刘敬伟;程乾生

【期刊名称】《北京大学学报：自然科学版》【年(卷),期】2002(38)5

【摘要】研究了动态时间规划 (DP)在基因芯片数据识别中的应用 ,提出了基因芯片数据的全局最大自相似度的定义以及基于最大自相似度和高维局部片段校对的基因芯片数据自动识别方法。讨论了基于最大相似度建立模板的方法与基于最大相似度的基因沿校对路径平均的建立模板方法对基因识别和分类的影响。对肿瘤基因的识别实验结果表明 :基于最大相似度的DP算法 (DP MS)能够达到 10 0 %的识别率 ,本方法可以应用于基因芯片数据的识别、分类和基因疾病推断。【总页数】5页(P611-615)

【关键词】数据识别;Smith-Waterman算法;动态时间规划;基因芯片;基因识别;最大相似度;模式识别【作者】刘敬伟;程乾生

【作者单位】北京大学数学科学学院信息科学系【正文语种】中文

【中图分类】Q78;TP391.4 【相关文献】

1.基于动态时间规整和主动外观模型的动态表情识别 [J], 许良凤;王家勇;崔婧楠;胡敏;张柯柯;滕文娣

2.基于动态时间窗的射频识别中间件数据过滤算法 [J], 王文闯;郭凤宇 3.基于动态规划库的规划识别算法的研究 [J], 冯萍

4.基于动态时间规整(DTW)优化积分直方图动态捕捉的持续人体动作识别研究 [J], 徐向艺;孔令春;马丽

5.基于AR模型的基因芯片数据识别 [J], 刘敬伟;程乾生

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