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分子生物学关键名词
2 基因、基因组和基因组学
基因:是指携带有遗传信息的DNA或RNA序列,也称为遗传因子。是控制性状的基本遗传单位。基因通过指导蛋白质的合成来表达自己所携带的遗传信息,从而控制生物个体的性状表现。
基因组:基因组(genome)是指一个细胞内的全部遗传信息。基因组中的DNA包括了编码序列和大量的非编码序列。 基因组学:基因组学(Genomics)是一门对生命有机体全基因组进行序列分析和功能研究的新兴学科. 反向重复序列:是指两个相同顺序的互补拷贝在同一DNA链上的反向排列。
假基因:假基因(pseudo gene)是指与某些有功能的基因结构相似,但不能表达有功能的基因产物的某些基因。假基因与有功能的基因同源,原来可能有功能,但是由于缺失、倒位突变的,是这一基因市区活性,成为无功能的基因。
3 蛋白质组学
蛋白质组: 是指一种基因组所表达的全套蛋白质,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。 蛋白质组学:是从整体水平研究细胞内蛋白质的组成、结构及其自身特有的活动规律的学科。
第四章无 5 基因诊断
基因诊断(Gene diagnosis):又称为分子诊断,即通过分子生物学和分子遗传学技术,直接检测遗传物质结构和表达是否异常,从而对疾病做出判断的方法。
聚合酶链反应(PCR):是指在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以特定引物为延伸起点,通过变性、退火、延伸等步骤,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA的过程。PCR是一项DNA体外合成放大技术,能快速特异地在体外扩增任何目的DNA。
6 基因治疗
1. 基因治疗(gene therapy) :是指将人的正常基因或有治疗作用的基因通过一定方式导入人体靶细胞以纠正基因的缺陷或者发挥治疗作用,从而达到治疗疾病目的的生物医学新技术。
2. 基因修复(gene correction):基因修复是指将致病基因的突变碱基序列纠正,而正常部分予以保留。这种基因治疗方式最后也能使致病基因得到完全恢复,操作上要求高,实践中有一定难度。
3. 药物靶向治疗(drugs targeting):即用反转录病毒载体的外源基因转移到细胞内 . 该基因编码一种酶,此酶可将一种无害的药物前体转变为细胞毒素复合物。
4. 反义技术:又称反义寡核苷酸(antisense oligodeoxynucleotides)技术,是指利用人工合成的反义RNA和反义DNA来阻断基因的转录或复制,控制细胞生长在中间阶段,使编码蛋白质的基因bu能转录为mRNA ,因而不能翻译成相应的蛋白质,以达治疗某一疾病的目的、用反义DNA已对某些癌症进行临床试验
5. 基因失活(gene inactivation):利用反义技术能特异地封闭基因表达特性,抑制一些有害基因的表达,已达到治疗疾病的目的。
7 生物分子的分离纯化
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生物大分子:生物大分子是指生物体内由分子量较低的基本结构单位首尾相连形成的多聚化合物。 盐析:在溶液中加入无机盐类而使某种物质溶解度降低而沉淀析出的过程称为 “盐析”
酚抽提法:以含EDTA、SDS及无DNA酶的RNA酶的裂解缓冲液裂解细胞,经蛋白酶K处理后,用pH8.0的Tris饱和酚抽提DNA。
溶剂提取法:溶剂提取法是根据各种成分在溶剂中的溶解性质,选用对活性成分溶解度大,对不需要溶出成分溶解度小的溶剂,而将有效成分从原材料中溶解出来的方法。
超滤法: 超滤是一种以压力为驱动力,利用超滤膜的筛分作用,根据相对分子质量的不同来进行分离的膜技术。
8 核酸分子杂交技术
1. 融解温度( melting-temperature , Tm ): DNA 的热变性是在一个很窄的温度范围内完成的,热变性过程中,紫外吸收值达到最大值的 50% 时的温度称为融解温度( melting-temperature , Tm )
2. 菌落杂交( Colony hybridization ):是将细菌从培养平板转移到硝酸纤维素滤膜上,然后将滤膜上的菌落裂解
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以释出 DNA ,将 DNA 烘干固定于膜上与 P 标记的探针杂交,放射自显影检测菌落杂交信号,并与平板上的菌落对位
3. 核酸分子杂交( nucleic acid molecular hybridization ):其原理是在 DNA 变性和复性的基础上,两条同源或异源的核酸单链( DNA 链、 RNA 链均可)在一定条件下根据碱基互补的原则重新形成双链。
4. 基因芯片 (gene chip) : 本质上是建立在核酸分子杂交基础上的,固定在玻片等载体上的微型生物化学分析系统,芯片上每平方厘米可密集排列成千上万个核酸分子,能快速准确地检测样品 DNA ,并获取样品中的有关信息 5. 正向斑点杂交( Forward Dot-blot ):通常简称为斑点杂交,是将待检样品( DNA 、 RNA 或细胞)直接点到膜上, 80 ℃ 烘烤固定。样品加到孔中,在负压下就会流到膜上呈斑点状或狭缝状。反复冲洗进样孔,取出膜烤干或紫外线照射以固定标本,这时的膜就可以进行杂交的标记 DNA 的探针,经相应的显色反应就能显出杂交信号。
9 聚合酶链反应技术及应用
聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR):是一种快速的特定DNA片段体外扩增技术。它模拟体内DNA复制过程,以dNTP为原料, 以变性DNA单链为模板,在DNA聚合酶作用下,由引物的3’端开始按照碱基互补配对原则合成DNA新链。反复合成DNA新链,便能特异地将极其微量的(pg水平)目的DNA片段迅速扩增上百万倍。 引物(primer):是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与感兴趣区域一端的一条DNA模板链互补,另一个引物与感兴趣区域另一端的另一条DNA模板链互补。
逆转录PCR (RT-PCR):检测RNA病毒、细胞因子mRNA时,一般不以RNA为模板直接扩增。在进行PCR之前,先将RNA在逆转录酶及逆转录引物作用下逆转录为cDNA,再以cDNA为模板进行PCR扩增。
巢式PCR (nest-PCR):是用两对引物,一对引物序列在模板的外侧,另一对引物序列在模板内侧(相对于第一对引物)。第一对引物做PCR的扩增产物作为第二对引物退火的模板,再做PCR。这样经过两次PCR放大,灵敏度得以提高,有时可检出单拷贝的目的基因。由于使用两对引物与模板结合,也大大提高PCR的特异性。
多重PCR (multiplex PCR):为提高效率,常采用多重PCR技术。该技术是在一个反应体系中加入多对引物,同时扩增出多个核酸片段,由于每对引物扩增的片段长度不同,可用电泳加以鉴别。
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