使用stata进行meta分析的详细具体过程和方法

2023-02-01 02:26:15 文档大全网 [ 字体：小中大 ] [ 阅读： ]

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使用stata进行meta分析的详细具体过程和方法

meta, stata

最近使用stata 8进行meta分析，之前已经使用refman 5进行了初步处理，但是refman的漏斗图只能粗略看是否对称，无法定量，据说stata可以进行发表性偏倚定量评价，所以自己摸索stata中的meta分析方法，在DXY中学习了不少战友的帖子（zhangdog战友），都感觉不是很系统，有的还有些问题。结合自己的体会，写个详细的总结，希望对像我一样的初学者有所帮助，尤其对很多非统计学专业的人员有用，当然我也不是统计学专业的，问题再所难免，共同学习，还望战友指点。

1.stata的安装，建议下载8.0的版本，有战友反映9.0和10.0的版本好象有些问题，反正基本功能有了，meta分析的菜单在8.0以后版本都有了，所以不必追求最新的。我是在www.epiman.cn上下载的。baidu，google上都能找到。 2.原始数据的录入，这是应用stata进行分析的基础。（1）命令窗口输入：

Input no study event1 total1 event0 total0

: |( g; m- [2 `; b3 `

（分别表示纳入研究序号，名称，暴露组或处理组例数，总例数，对照组例数，对照组总例数，因为我是用refman中导出数据，这后4项可以直接输出），作用是产生变量。然后可以逐行输入数据，以end命令结束，我建议初学者跳到下面的输入更简单。

* s# ?- w; d: B6 v$ L- j

（2）点Data——Data editor（或ctrl＋7快捷键），可以直接录入数据，可以直接复制，粘贴数据。输完后点击preserve保存退出Data editor 窗口。

6 z7 T5 M3 H5 ~% 第一步（1）也可以省略，进入第二步后，先输入数据，然后双击自动产生的变量var1,var2....进行变量名称的修改，个人感觉这样快捷。 1 Deng SL 2004 31 114 8 1002 Ding HF 2006 19 25 5 8

^3 h2 l* t6 W9 ?" \$ _" o- S

* Z4 U' m+ R$ i4 i8 V( P&

3 Fang ZL 2002 35 36 20 35

@5 ?* E& [! + C& ?* ^) Q3 y! lR, F' F1 4 Ito K 2006 36 40 31 40 5 Kao JH 2003 81 127 4 35

m/ y4 w2 R. y: h4 ~5 a

6 Yuen MF 2004 60 66 101 135

1 V3 [0 M& Y4 ~. B. x- a. B% l*

; r `( L/ n0 ~- d! u, W

完毕在命令窗输入list命令查看数据。

可以参考陈峰主编《现代医学统计学与stata应用》一书，搜索战友“紫竹林之舞”的帖子里有电子版。

y5 }- z* r+ a1 Z

3.输入meta分析命令进行处理。常用中间命令和函数：

) Q) \' d; y- T2 f. . e, L8 a3 I; S/ B

.generate（gen）产生变量和数据

X- L+ A. X& X* f" L

.replace 替代变量和数据，在重复处理相似数据的时候使用。

.generate nonmu1=total1-event1 .generate nonmu0=total0-event0

4 S% e' S* |6 d3 x4 A* O. v5 |) v

.generate logor=log((event1/nonmu1)/(event0/nonmu0))（logor为OR值的常用对数，后面括号内为OR值的直接结算公式，即暴露组的发病率与对照组发病率的比值比oddis ratio）

. h! X" n7 vgenerate selogor=sqrt((1/event1)+(1/nonmu1)+(1/event0)+(1/nonmu0))

% _0 \$ U. T9 （selogor为组内方差的对数）

( N0 P# _5 W* r5 R0 r

4.metan可以直接输出or（95％CI）和森林图。

1 @: x) b, J- l! B$ s2 `'

7 l8 @" w: f( h+ ^& J+ H/ l. T

metan event1 nonmu1 event0 nonmu0, or xlab(.1,1,10) label(namevar=study)5. metacum计算累计or值和图形输出

7 O/ } _/ J9 `# s7 d

metacum logor selogor, effect eform graph cline xline(1) xlab(.1,1,10) id(study) b2title(Odds ratio)

6. metainf评价除去某文献后的合并效应变化，我个人理解就是相当于敏感性分析，不当之处请战友指出。

4 [8 ^9 S0 o$ @4 K: n8 y#

( I' }0 t/ s- { 7 T" W- H; t; A

metainf logor selogor, eform id (study)

7. metabias命令定量评价发表性偏倚，给出p值和95％CI，注意p值大于0.05和95％CI包含1为无发表性偏倚。同时给出begg和egger两种算法，但是我看文献中使用egger的比较多，图形给出也有两种，begg图就是漏斗图，和refman的类似，不过方向有些不同而已。请问战友不知道应该如何选择，Egger用 (weighted regression) method 而Begg 用(rank correlation method).。

metabias logor selogor if no<10, graph(begg)

" I. w2 O2 k! S, d

命令来源参考：Systematic Reviews in Health Care一书，chapter 18

8 _' C* R2 [$ Khttp://www.blackwellpublishing.com/medicine/bmj/systreviews/samplechap.asp 8.注意事项：

命令输出的时候全部小写，否则stata不识别

8 Z! m3 I3 T8 T* k8 A

) t h# W, C' W]' }7 @, u8 L0 s

结果输出直接复制，粘贴，ctr＋c和ctr＋v，包括输出的数据和图形。

请战友讨论问题：

1.我按照zhangdog战友给出的公式，将refman生成的or，LL,UL直接输入，generate logor=log（or）

" z9 y: ~5 h, ~: J0 Q0 8 j0 F; [1 I7 G2 L! R* I- P0 i

generate selogor=(log(ul)-log(ll))/2*1.96

直接计算logor和selogor为何结果与refman计算的差别很大，后来我用直接计算结果和refman计算的近似。不知道原因何在？

) @" }' r3 w- e) R

selnrr可以根据治疗效应的可信区间来计算(以95%可信区间为例）：selnrr=(log(ul)-log(ll))/2*1.96