1个玉米高亲和K+转运体HKT的生物信息学分析

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1个玉米高亲和K+转运体HKT的生物信息学分析

陈靓靓;罗为桂;刘清;苏益

【期刊名称】《湖南农业科学》【年(卷),期】2012(000)019

【摘要】植物HKTs具有Na+(或K+)单向运输或Na+-K+共转运功能.利用各种生物信息学工具分析了1个从玉米中获得的HKT的氨基酸序列,并预测了其功能.结果表明:目标蛋白属于HKT的亚家族Ⅰ,与OsHKT1;5和TaHKT1;5蛋白进化关系较近,命名为ZmHKTI;5.该蛋白呈弱碱性,疏水性较强,具有8个跨膜结构,其二级结构含58.67％α螺旋(H),7.07％β折叠(E)和34.26％无规卷曲(L),三级结构为典型的膜蛋白.推测该蛋白可能具有Na+选择性并在玉米的耐盐机制中起作用.%The high-affinity K+ transporters (HKTs) in plant can mediate Na+/K+-uniport or Na7K+-symport. To predict the functions of a HKT in maize, a series of bioinformatics tools were used to analyze the amino acid sequence of HKT. The results showed that the target protein can be categorized to subfamily I of HKT and was named as ZmHKTl;5, which was similar to 0sHKTl;5 and TmHKTl;5 in amino acid sequence. The protein showed weakly alkalescent and strong hydrophobieity and have eight transmembrane structures. ZmHKTl;5 have 58.67% of a梙elix (H), 7.07% of p梖old (E) and 34.26% of random coil (L) in secondary structure, and its tertiary structure is a typical membrane protein. So, it is predicted that ZmHKTl;5 maybe have a specific selectivity for Na+ and plays an important role in salinity tolerance of maize.

【总页数】4页(P22-24,28) 【作者】陈靓靓;罗为桂;刘清;苏益

【作者单位】湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128;湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128;湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128;湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙410128 【正文语种】中文【中图分类】S513 【相关文献】

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